主要区别在于：本罪对象限于古文化遗址、古墓葬，故意损毁文物罪和故意损毁名胜古迹罪的对象则限于文物、名胜古迹；在客观方面，本罪表现为私自掘取，其行为方式多为秘密的，而故意损毁文物罪和故意损毁名胜古迹罪则表现为损毁行为，行为的形式多种多样，包括捣毁、损坏、污损、拆除、挖掘、焚烧等；在主观方面，本罪一般具有非法占有文化遗址、古墓葬中文物的目的，而故意损毁文物罪、故意损毁名胜古迹罪则只是出于破坏的故意。其动机可能多种多样，但并无对文物非法占有的目的。