商标侵权刑事案件立案标准为：非法经营数额在五万元以上或者违法所得数额在三万元以上的；假冒两种以上注册商标，非法经营数额在三万元以上或者违法所得数额在二万元以上的；其他情节严重的情形。

【法律分析】

侵犯注册商标专用权的行为有：
1、未经商标注册人的许可，在同一种商品上使用与其注册商标相同的商标的行为；
2、伪造、擅自制造他人注册商标标识或者销售伪造、擅自制造的注册商标标识的行为；
3、销售侵犯注册商标专用权的商品的行为。

【法律依据】

《中华人民共和国》 第二百一十三条 【】未经注册商标所有人许可，在同一种商品、服务上使用与其注册商标相同的商标，情节严重的，处三年以下，并处或者单处；情节特别严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
第二百一十四条 【销售假冒注册商标的商品罪】销售明知是假冒注册商标的商品，违法所得数额较大或者有其他严重情节的，处三年以下有期徒刑，并处或者单处罚金；违法所得数额巨大或者有其他特别严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
第二百一十五条 【非法制造、销售非法制造的注册商标标识罪】伪造、擅自制造他人注册商标标识或者销售伪造、擅自制造的注册商标标识，情节严重的，处三年以下有期徒刑，并处或者单处罚金；情节特别严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。