双重国籍入境系统会自动查出来。留存出境入境人员的生物识别信息是加强出入境管理的重要举措，目前国际上已有包括美国、日本、新加坡等多个国家实施这一措施。生物识别信息除了指纹外，还包括面相、虹膜等人体特有生理特征。

【法律分析】

中华人民共和国不承认中国公民具有双重国籍，如果获得外国国籍，其中国国籍已经自动丧失，并不存在违法的问题。中国政府处理双重国籍的态度是：（1）坚持一人一国籍，不允许任何中国公民有双重国籍。（2）尊重本人意愿，不强制或违背本人意愿选择国籍。（3）如果中国公民在他国获得他国国籍，则视为自动放弃中国国籍。但有必要时可以恢复中国国籍。

【法律依据】

《中华人民共和国国籍法》 第三条 
中华人民共和国不承认中国公民具有双重国籍。
第九条 定居外国的中国公民，自愿加入或取得外国国籍的，即自动丧失中国国籍。
第十四条 中国国籍的取得、丧失和恢复，除第九条规定的以外，必须办理申请手续。未满十八周岁的人，可由其父母或其他法定代理人代为办理申请。